למרות שגם MOC וגם MOFs מכילים קשרי תיאום אורגניים-מתכתיים, ישנם הבדלים מהותיים:
מימדיות: MOCs הם מולקולות בדידות 0-ממדיות, בעוד MOFs הן רשתות דו-ממדיות או תלת-ממדיות המורחבות באופן אינסופי.
מסיסות: רוב ה-MOCs מסיסים, בעוד MOFs בדרך כלל בלתי מסיסים.
יציבות: ל-MOF יש בדרך כלל יציבות תרמית גבוהה יותר.
מיקוד יישום: MOCs מצטיינים בזיהוי מולקולרי, בעוד MOFs מתאימים יותר לאחסון גז.
